"Hrála ve své první hře a nenáviděla to. Ulevilo se mi, protože to není snadné," řekla herečka magazínu Stylist.
Andersonová to také ve svých začátcích neměla jednoduché. Od herectví ji zrazoval otec, který se o dceru bál, aby se vůbec uživila.
"Pamatuji si, jak si mě můj otec posadil, když se dozvěděl, co jsem se rozhodla dělat. Byl velmi znepokojený a řekl mi, že jen pět procent herců pracuje a měla bych se naučit pracovat s wordem, protože počítače hodně změní budoucnost a měla bych mít tyto dovednosti," přiznala Andersonová, která si hraní nakonec vybrala.
Herečka Gillian Andersonová byla dvakrát vdaná. S exmanželem Clydem Klotzem, s nímž se rozvedla v roce 1997, má dceru Piper Maru. S druhým mužem Julianem Ozannem vydržela v manželství do roku 2006. Tehdy také potkala Marka Griffitha, se kterým má šestiletého syna Oscara a čtyřletého Felixe. Pár se nevzal a loni potvrdil rozchod (více zde).